היועצת המשפטית לכנסת, עו"ד שגית אפיק, הגישה תגובה רשמית לבית המשפט העליון במסגרת העתירה העוסקת בכינוס המליאה לצורך עריכת בחירות חוזרות למבקר המדינה. בתגובתה, חזרה עו"ד אפיק על עמדתה המשפטית לפיה על הכנסת לפעול בהקדם האפשרי לקיום פסק הדין שניתן בעניין זה, אשר קבע כי הבחירות הקודמות לתפקיד פסולות. נציין כי מדובר בהליך משפטי מתמשך המעורר מחלוקת עמוקה בין הדרגים הפוליטיים לייעוץ המשפטי בבית המחוקקים. בתגובה שהוגשה לבג"ץ, התייחסה עו"ד אפיק לאתגרים המשפטיים והפרוצדורליים שנוצרו מאז מתן פסק הדין.
היא ציינה כי חלו שינויים מהותיים בהרכב המליאה, הכוללים התפלגות סיעות, התפטרות של חברי כנסת וכניסת מחליפים שלא לקחו חלק בהצבעה המקורית. כמו כן, הובאו בחשבון שיקולים הנובעים מהפגרה הפרלמנטרית ומהסמיכות לבחירות, אשר השפיעו על לוח הזמנים והיכולת ליישם את החלטת בית המשפט באופן מיידי. השתלשלות אירועים זו מגיעה לאחר שחמישה שופטי בג"ץ, בראשות הנשיא יצחק עמית, פסלו פה אחד את תוצאות הבחירות הקודמות למבקר המדינה. בפסק הדין נמתחה ביקורת נוקבת מצד המשנה לנשיא, השופט נעם סולברג, על הוראות שניתנו לחברי הכנסת בנוגע לתיעוד הצבעתם, דבר אשר לדבריו עלול לרוקן מתוכן את הוראות חוק היסוד ולהפוך אותן לאות מתה.
במקביל להליכים המשפטיים, נוצר עימות חריג בתוך מוסדות השלטון. לפי דיווחים שפורסמו בחדשות 13, יו"ר הכנסת, אמיר אוחנה, הביע התנגדות לקו המשפטי שמובילה היועצת המשפטית לכנסת. בשל כך, פנה אוחנה לקבלת ייצוג משפטי פרטי בתיק, מחוץ למסגרת הייצוג המקובלת על ידי הייעוץ המשפטי לכנסת, זאת לאחר שהתברר כי קיימת מחלוקת מקצועית עמוקה בינו לבין עו"ד אפיק בנוגע לחובה לציית לפסיקה. על פי הפרסומים, גם שר המשפטים יריב לוין ויו"ר הקואליציה אופיר כץ הביעו הסתייגות מקיום בחירות חוזרות בהתייעצויות סגורות. נושא זה מדגיש את המתיחות המוסדית סביב סמכותו של בית המשפט אל מול פעילות הרשות המחוקקת וחובת הציות לפסיקה במערכת הדמוקרטית הישראלית.